Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL4A3Q01955 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL4A3Q01955 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms