Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms