Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD3P84022 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms