Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRX1P78414 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRX1P78414 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRX1P78414 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRX1P78414 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRX1P78414 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRX1P78414 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRX1P78414 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRX1P78414 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRX1P78414 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRX1P78414 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms