Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HBBP68871 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HBBP68871 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HBBP68871 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HBBP68871 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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