Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM4P67936 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPM4P67936 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPM4P67936 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM4P67936 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM4P67936 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM4P67936 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM4P67936 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM4P67936 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPM4P67936 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms