Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms