Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCS1P62166 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCS1P62166 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms