Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFM1P61960 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms