Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB4BP61018 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4BP61018 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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