Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms