Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA9P57773 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA9P57773 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA9P57773 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms