Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF3P57682 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLF3P57682 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLF3P57682 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms