Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX17P56962 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX17P56962 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX17P56962 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX17P56962 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX17P56962 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX17P56962 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms