Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP9P55211 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP9P55211 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP9P55211 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP9P55211 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms