Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKAP1LP55160 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms