Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1B3P54709 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms