Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATN1P54259 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms