Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRISP1P54107 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms