Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBX1P52954 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms