Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RND2P52198 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RND2P52198 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RND2P52198 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RND2P52198 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RND2P52198 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RND2P52198 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms