Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPOP42166 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMPOP42166 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMPOP42166 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPOP42166 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPOP42166 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms