Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTGDSP41222 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms