Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPHP41219 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPHP41219 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPHP41219 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPHP41219 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPHP41219 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPHP41219 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms