Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCAP37840 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCAP37840 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNCAP37840 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNCAP37840 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNCAP37840 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms