Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBRP36941 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBRP36941 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBRP36941 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBRP36941 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms