Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGFBR1P36897 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms