Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms