Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPC1P35052 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPC1P35052 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPC1P35052 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms