Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms