Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms