Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms