Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPRR1BP22528 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPRR1BP22528 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms