Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF1P22415 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF1P22415 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF1P22415 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF1P22415 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USF1P22415 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF1P22415 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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