Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA1P20936 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA1P20936 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA1P20936 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA1P20936 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA1P20936 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA1P20936 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA1P20936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA1P20936 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA1P20936 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA1P20936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms