Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms