Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A2P16615 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms