Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP3P12645 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP3P12645 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP3P12645 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP3P12645 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms