Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms