Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF1P09603 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF1P09603 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF1P09603 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms