Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTBP09497 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTBP09497 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTBP09497 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTBP09497 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTBP09497 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTBP09497 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTBP09497 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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