Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB1P08034 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB1P08034 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms