Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPBP07199 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CENPBP07199 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPBP07199 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPBP07199 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms