Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA4P05014 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms