Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POP4O95707 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POP4O95707 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POP4O95707 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POP4O95707 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POP4O95707 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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