Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN1O94985 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms