Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms