Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms