Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCNKO75909 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCNKO75909 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNKO75909 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNKO75909 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms