Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUBNO60494 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms